Prémia SC PEN za rok 2021 za knihu Záchrana sveta podľa G
Cena Ondreja Štefanka za rok 2021 (Kultúrna a vedecká spoločnosť Ivana Krasku so sídlom v Nadlaku spolu so Svetovým združením Slovákov v zahraničí)
V desiatke Anasoft litera 2021
V desiatke Anasoft litera 2020
Cena Ladislava Ťažkého za rok 2019 za dielo Hodiny lietania
Prémia Literárneho fondu za rok 2019 v kategórii próza za dielo Hodiny lietania
Mestské zastupiteľstvo Levoče udelilo Etele Farkašovej čestné občianstvo Za výnimočné výsledky vedeckej a umeleckej práce, ktorými dlhodobo prispieva k šíreniu dobrého mena mesta Levoča doma i v zahraničí
Krištáľové krídlo za rok 2018 v kategórii publicistika a literatúra Čestná pocta za celoživotné literárne dielo
V päťke Anasoft litera 2018
Cena Anasoft litera 2018 za román Scenár (2017)
Finalistka Ceny Jána Johanidesa, román Scenár (2017)
Prémia SC PEN za román Scenár (2017)
Cena Ladislava Ťažkého za prózu (udeľuje Spolok slovenských spisovateľov) za román Scenár (2017)
Prémia Literárneho fondu v kategórii esejistiky za dielo Vrstvenie času (2014)
Cena Literárneho týždenníka za recenzistiku a za preklad súčasnej rakúskej prózy a poézie (2015)
Pamätná medaila rektora UK (2014)
Finalistka Ceny Jána Johanidesa (za prózu Na rube plátna)
Cena predsedu NR SR Za výnimočný prínos v oblasti literatúry a filozofie (2014)
Prémia Literárneho fondu za celoživotný prínos k rozvoju slovenskej vedy doma i v zahraničí (2014)
Pamätný list SC PEN (2014)
Cena Slovenských pohľadov za literárnu kritiku a históriu za rok 2013
Prémia Literárneho fondu za pôvodnú literárnu tvorbu za rok 2012 za prózu Pláne približne zapamätaného
Prémia Literárneho fondu za pôvodnú literárnu tvorbu za rok 2009 za dielo Čas na ticho
Cena Bibliotéky 2009 za novelu Fragmenty
V desiatke Anasoft litera 2006
Finalistka Anasoft litera 2005
Cena Slovenského centra PEN za rok 2005 za novelu Stalo sa
Zlatý čestný odznak za zásluhy o Rakúsku republiku (2004)
Cena Spolku slovenských spisovateľov (1997)
Cena nakladateľstva Pravda za monografiu Teória poznania (1988 – spoluautorka)
Cena Ivana Kraska za debut Reprodukcia času (1978)
Je nositeľkou viacerých medailí Filozofickej fakulty Univerzity Komenského v Bratislave
